Za uklanjanje različitih vrsta malicioznih programa potrebno je imati različite vrste “antivirusnih alata” te ih na pravilan način iskoristiti kako bi se uklonili svi neželjeni zlonamjerni programi koji dodatno usporavaju rad i dovode u pitanje sigurnost korisničkih podataka.
Kao što je već spomenuto, čišćenje od zlonamjernih programa se odvija određenim redoslijedom, jer je to najsigurniji i najbrži način skeniranja.
U prvom postupku se uklanjaju privremene datoteke (??), povijest, cookies i preuzete datoteke iz web preglednika koji se koriste za surfanje internetom. Osim navedenih, uklanja se sadržaj iz smeća, privremene datoteke i log datoteke iz windows-a. Dosta često se problemi rješavaju uklanjanjem starih ili nekorištenih unosa iz registra iako pritom treba biti jako oprezan jer uklanjanje unosa iz registra bitnog za rad sustava može usporiti rad i onemogućiti neke funkcionalnosti.
